Alors qu'elle est en mission de surveillance lors d'un voyage interstellaire à bord du « Valley Forge », l'escouade Alpha découvre que le major Barcalow a été infecté par les Arachnides : Il est devenu un mutant. La SICON planifie l'attaque générale de la planète mère des Arachnides : Klendathu. Brutto étant paralysé des jambes, il doit quitter l'escouade Alpha. Rico le remplace comme sergent de l'unité. L'escouade Alpha est affectée à un fortin avancé. Elle est attaquée par une nouvelle espèce Arachnide. À la suite du crash de leur vaisseau loin derrière les lignes ennemies, l'escouade Alpha se retrouve isolée. Elle subit alors un assaut frontal. Les parasites s'enfoncent dans leurs galeries souterraines pour ne pas subir les bombardements de l'aviation du SICON. L'escouade Alpha est choisie pour éliminer la reine des Arachnides de Klendathu.